南瓜内含有维生素和果胶，果胶有很好的吸附性，能黏结和消除体内细菌毒素和其他有害物质，如重金属中的铅、汞和放射性元素，起到解毒作用。
南瓜所含果胶还可以保护胃肠道黏膜，免受粗糙食品刺激，促进溃疡面愈合，适宜于胃病患者。南瓜所含成分能促进胆汁分泌，加强胃肠蠕动，帮助食物消化。南瓜能消除致癌物质亚硝胺的突变作用，有功效，并能帮助肝、肾功能的恢复，增强肝、肾细胞的再生能力。调节胰岛素的平衡，维持正常的血压和血糖，也是肥胖者的理想食品。南瓜还可以预防中风，因南瓜里含有大量的亚麻仁油酸、软脂酸、硬脂酸等甘油酸，均为良质油脂。
吃南瓜除了不宜长期大量食用以外，还有很多需要注意的地方。南瓜是发物，如果患有脚气、黄疸等疾病，吃南瓜会导致这些疾病病情加重，如果患过这些疾病，可能会导致这些疾病反复。如果长期吃南瓜，可能是会对健康造成很大影响的，由于南瓜是温性食物，如果在吃南瓜期间没有摄取适量的寒性食物，就很可能会使人出现上火等不适症状，而且病情会随着继续吃南瓜而不断加重。而且南瓜还容易滋生湿气，长期吃南瓜容易是体内残留大量的湿气，这些湿气容易诱发各种疾病，对健康是非常不利的。